Las LGAC del Doctorado en Ciencias tienen plena concordancia con los objetivos, metas y perfil de egreso del plan de estudios. El programa cuenta con 4 LGAC, que contribuyen a la generación de conocimiento en áreas prioritarias para el desarrollo regional y nacional:
- Biología, biodiversidad y control de artrópodos
- Evaluación nutricia y funcional de recursos vegetales, pesqueros y subproductos agropecuarios
- Manejo y aprovechamiento sustentable de recursos naturales
- Manejo y conservación de vida silvestre